A Unidade de Urgência/Emergência do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Marília é referência para atendimento à Marília e região (DRS-IX), com uma área de abrangência de aproximadamente 1.200.000 mil habitantes. Com uma equipe multiprofissional composta por médicos, enfermeiros, auxiliares de enfermagem, assistentes sociais e recepcionistas, além de profissionais de outras áreas (limpeza, manutenção, nutrição, porteiros), a Unidade presta assistência de qualidade e oferece estágios curriculares para o cursos de Medicina e Enfermagem, para a residência médica e estágios extracurriculares para instituições conveniadas.

Dentro da área médica conta com plantonistas nas especialidades clínica, cirúrgica, psiquiátrica e ortopédica. Como retaguarda, dispõe de Serviço de Diagnóstico por Imagem e Laboratório nas 24 horas. A sala de emergência da Unidade, devidamente equipada, funciona como "vaga zero" para o SAMU-192 e para a Central de Regulação Médica DRS-IX e CROSS. Conta com o Serviço de Acolhimento e Triagem para Urgências, utilizando para tal protocolo de classificação de risco de Manchester modificado com melhoria na qualidade da recepção, atendimento e direcionamento do atendimento destes pacientes. Com isso, a Unidade se consolida na posição de referência SUS para atendimento de Urgência e Emergência e como pólo formador de recursos humanos na área.