Diretoria de Pós-graduação é responsável por planejar, acompanhar e coordenar as atividades acadêmicas e de pesquisa no âmbito da Pós-graduação Stricto e Lato sensu, para o cumprimento das normas regimentais.
A Pós-graduação Stricto sensu compreende os Programas Pós-graduação em Saúde e Envelhecimento (PPGSE) e em Ensino em Saúde, ambos com o curso de Mestrado pertencentes a área Interdisciplinar da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) e com conceito 4 na avaliação quadrienal da CAPES. O curso de doutorado de PPGSE foi aprovado em 2024 pela CAPES e aguarda homologação pelo Ministério da Educação.
A Pós-graduação Lato sensu abrange 29 especialidades de Residência Médica, cinco programas de Residência Multiprofissional em Saúde e um curso de Especialização em Psicoterapias de Orientação Psicanalítica.